商標権を取得するメリットは大きく分けて3つあります。

1つは企業や商品名・ロゴなどを独占的に使用する法的な力が得られるということです。
例としては、他者が同じ社名や商品・サービス名を使ったとき、差し止め請求や、損害が出ている場合には損害賠償請求ができます。

たとえば株式会社○×機械工業をあなたが立ち上げたとします。
数年後あるヒット商品が生まれ、会社の知名度が上がりました。
しかしそこで、同じ社名を利用して異なる機械を売る人が現れたらあなたはどう思いますか？自分の会社およびその関係者に非常に迷惑だと感じるでしょう。もしここで商標権を取得しておけば、損害を被ったとして損害賠償を請求できるわけです。

2つ目として商標権を取得することで他人が同じ商標権を取ることへの牽制となります。
結果として会社や商品ブランドが守れるのです。

さらに3つ目として自分の持っている商標を他人が使いたいと申し出があったとき、
ライセンスとして使用許可すると同時に、使用料金を徴収することができるのです。